故事讲述了死神武器职人专业学院，简称“死武专”，学院里的学生分为“工匠”和“武器”，而他们的目的是收集“99个偏离人类轨道已形成‘鬼神之卵’”和“1个魔女的灵魂”，当“武器”吞噬这100个灵魂后就能升级成为死神专用武器Death Scythe

噬魂师NOT全集动画改编自大久保笃创作漫画《噬魂师》的外传漫画。噬魂师NOT全集动画讲述的是非常普通的少女春鸟鸫、天然少女多多音美美、傲娇的公主大人阿妮亚赫本在死武专的校园生活以及杀戮故事展开。噬魂师全集动画故事的核心舞台是位于美国内华达州，由死神所统治的Death City。Death City内有着死神所经营的死神武器专门学校。简称死武专。学生们分为工匠跟武器，他们根据死神的指令来猎杀罪人的灵魂，最终的目的是收集99个偏离人类轨道的人灵魂之卵与一个魔女的灵魂之卵来将武器进化成死神的武器Death Scythe。同时也为了不成为鬼神而进行着修行……