多事的追命（郑中基 饰）、铁手（邹兆龙 饰）耍花招，撮合冷血（邓超 饰）、无情（刘亦菲 饰）这对小情人，神侯府上下正其乐融融，空气却传来浓烈的血腥味道，三里之外的城郊老宅，杀人凶案正在发生！ 四大名捕前往现场，奋力追凶。 六扇门接获消息，捕神（成泰燊 饰）也带同姬摇花（江一燕 饰）等前来了解案情，双方合并追查，发现此案与六扇门早前追查的几宗灭门案有牵连。 悬案未决，六扇门却在碑林发现了捕神的尸体，而此前正是诸葛先生（黄秋生 饰）约捕神在碑林见面，一切线索都指向了诸葛先生。为探明真相，诸葛正我回到碑林查看，没想到却碰到了一位绝迹江湖多年的老朋友。双方对峙之时，四大名捕和六扇门也相继赶到，再生枝节。六扇门将诸葛先生和无情收押天牢。 四大名捕群龙无首，名存实亡。此时，王爷（李子雄 饰）忽访天牢，奉皇上旨意要即刻治无情死罪。铁血大牢之内，一场权力、仇恨、爱情、友情的角力就此展开……

明朝的安全机构"神侯府"与"六扇门"之间为破同一件大案,斗智斗勇但最后齐心协力侦破案件的故事.

　　诸葛神候：68岁。四大名捕的师傅。贵胄之后，世袭爵位，与皇室有关系。能自由出入宫廷，武功高强，深谋远虑。饱读诗书，气质高华，除琴棋书画外，并习有方阵及奇门遁甲之术。受钦命创设六扇门，带领四大门徒除奸伏恶，尽扫江湖间不平事。

承接《四大名捕2》，无情（刘亦菲 饰）离开后，冷血（邓超 饰）为追查捕神死因回到六扇门，“四大名捕”分崩离析，名存实亡。此时，皇宫却出大乱。不愿被困皇宫的宋徽宗（苏有朋 饰）执意微服出访，却遭刺杀，而后皇帝失踪。冷血、铁手（邹兆龙 饰）、追命（郑中基 饰）联手追查，无情冷眼旁观、伺机复仇，一个潜藏已久的惊天阴谋即将彻底浮现，武功盖世的幕后黑手也行将出手，“四大名捕”将迎来生死之决、终极一战。

该剧以追捕叶三天为首的越狱逃犯为线索，表现我公安局118专案组里的四名刑警的大智大勇，为了侦破危害广大人民群众的两起人命案件，做了大量细致、周密的调查，渐渐将目标锁定了以叶三天为首的五人犯罪团伙，并终将这个团伙绳之以法。此剧热情讴歌了以姚长军、夏天、候小雨、杨文来四大名捕为代表的公安民警的英勇善战，无私奉献的可贵精神。

北宋徽宗年间，镇远大将军凌落石与当朝奸相蔡京相互勾结，狼狈为奸，致使朝纲败坏，国势日衰。身兼武林大联盟副盟主的凌落石，更因觊觎武林盟主宝座，而趁盟主冷悔善过寿时，将其杀害，取而代之，冷悔善幼子冷血（蒋毅 饰）侥幸死里逃生，并为太傅诸葛神侯（岳跃利 饰）收养于狼窟中长大。诸葛神侯为对抗武功高强、阴险狠毒的凌落石，除个别传授冷血武功，亦同时培养另外三位极具资质潜力的血气青年追命（钟汉良 饰）、无情（朱磊 饰）、铁手（车仁表 饰）分别授与武功有成后，以分进合击方式，展开连串刺杀凌落石之艰巨任务。四人呗诸葛神封为“六扇门御前四方总捕” ——东方总捕铁手、南方总捕追命、北方总捕无情、西方总捕冷血，四人分别保卫着四方各地安宁。

本剧改编自温瑞安之武侠经典小说《四大名捕》，本剧写的是无情、铁手、追命和冷血四大名捕的传奇故事。四人虽同为一代奇人诸葛神侯的弟子，却彼此互不相识，各自以不同的身份现身江湖，从此在武林的一场场浩劫中演绎着正义与邪恶的较量。天下英雄齐聚“插天山庄”，为武林盟主冷悔善贺寿，不料，副盟主凌落石谋反...

明朝年间，神侯府接到了一桩离奇的案件，城中不断有人在梦中入魔。其症状犹如梦游一般，中魔者在梦境中被梦魔操控，变成非人非魔的怪物扰乱城中百姓安危。神侯府四大名捕之一的无情、追命奉命调查此事。在解梦师白晓茹的帮助下，觉察到“魔在梦中”若想制服梦魔必须进入梦境，方能解救城中的危机。无情和追命决定和白晓茹前往梦镇，请她师傅延吉大师帮忙。延吉大师道出了“梦魔”的身世。原来“梦魔”乃幽若大师，她是百年前解梦界的第一人，梦镇也是由她一手创建的。但她的名声大噪却换来了同行的嫉妒，被陷害下了“甩头蓝”之毒。杀死了许多无辜的百姓，大家也从原来的尊敬变成了畏惧。

明朝中期,神侯府总管诸葛正我率手下四大名捕冷血、追命、无情、铁手四人护卫京城。冷血救下出逃秀女楚离陌,将其藏匿于神侯府之中，而后诸葛正我发现离陌身上的读心术,留府培养。冷血和离陌二人起初性格不合，误会不断，而后历尽重重艰险逐渐相知相许，最终走到一起。王爷安世耿一心排除异己制造混乱，视四大名捕为死敌。女神捕姬瑶花暗恋冷血，对离陌心生妒忌，后又遭安世耿利用，四大名捕联手对付安世耿。

事缘诸葛神侯夜观天象之时，发现自身将有一大劫降临，另一方面，邪派高手上官苍穷，因曾败于诸葛神侯手下，故一心想复仇，矢誓要坐神侯之位，而他苦待多年，终于等到诸葛神侯气数最弱之时，遂密谋一举而杀诸葛神侯，而诸葛神侯也深知自己若不在人世，则定必剧盗蜂起，其势不可收拾，苦思之下，决定兵行险着，布下一假死之局，暗中却策令已退隐的四大名捕回京，以代其位，希望将影响减至最低，此外，另一邪派高手胡天龙因多年前被诸葛神侯赶出中原，远赴日本，并收得日本人古月正文为徒，并曾立誓中原有诸葛神侯一日，便不再踏足中原半步，此时为想回归中土，遂遣其弟子，古月正文到中原杀诸葛神侯，于是，便引出一连串勾心斗角，悬疑诡秘，迂回曲折的故事。

城郊命案发生，四大名捕前往现场缉凶，不料引出十五年前杀害无情全家之惨案，名捕们顺藤摸瓜，牵出各种隐情，上演了一连串精彩冒险。个人恩怨与天下苍生之间，名捕们该如何抉择？又怎料血战之后，更大的风暴紧接而来。

张宁（夏雨 饰）是一名香港黑拳手，为了向女友孙静（杨采妮 饰）证明自己，张宁受雇在香港杀人，案发后与女友踏上了逃亡之路。一年后，甘肃警方昔日的“四大名捕”——“豹子”向西（段奕宏 饰）、“藏獒”何建中（倪大红 饰）、“羊倌儿”杨晓明（吴京 饰）与“牦牛”韩朝东（张立 饰）齐聚戈壁，追捕张宁。与此同时，因张宁偷拍了雇主的照片，并以此作为要求警方不追究孙静的筹码，成名已久的国际杀手麦高（吴镇宇 饰）受命携师傅的孙女阿诺（余男 饰）不远千里追索张宁，以毁灭证据。一时间，三方在戈壁为各自生存或使命激烈碰撞，展开了连场激战……

金陵大牢被江湖神秘杀手闯入，死者竟只是一个矿工，六扇门受朝廷指令赶赴金陵大牢查探此案，本以为六扇门会派出一等一的捕快前去侦破，不料迎来的却是四位初出茅庐的女捕快，四人虽年纪轻轻，却个个身怀绝技。四人查到杀人案和金陵银矿有关，恐怕有人中饱私囊被发现才杀人，当查到最大帮派九龙也牵扯此事时，几人找到矿监陈增长，却不料和县令左衡之一样，惨遭毒手被人暗杀，带领四人的大师兄沐长风也在回京途中被人袭击身受重伤昏迷不醒，而此时，四人发现县令之子左靖的师父萧天南可能和陈增长勾结私吞银矿并杀人灭口，在失去大师兄的庇护之下，四个女孩利用自己的独门本事层层抽丝剥茧，最终摆脱险境将萧天南擒住，并帮助朝廷追回失踪的银矿。