该剧以追捕叶三天为首的越狱逃犯为线索，表现我公安局118专案组里的四名刑警的大智大勇，为了侦破危害广大人民群众的两起人命案件，做了大量细致、周密的调查，渐渐将目标锁定了以叶三天为首的五人犯罪团伙，并终将这个团伙绳之以法。此剧热情讴歌了以姚长军、夏天、候小雨、杨文来四大名捕为代表的公安民警的英勇善战，无私奉献的可贵精神。

　　诸葛神候：68岁。四大名捕的师傅。贵胄之后，世袭爵位，与皇室有关系。能自由出入宫廷，武功高强，深谋远虑。饱读诗书，气质高华，除琴棋书画外，并习有方阵及奇门遁甲之术。受钦命创设六扇门，带领四大门徒除奸伏恶，尽扫江湖间不平事。

明朝的安全机构"神侯府"与"六扇门"之间为破同一件大案,斗智斗勇但最后齐心协力侦破案件的故事.

多事的追命（郑中基 饰）、铁手（邹兆龙 饰）耍花招，撮合冷血（邓超 饰）、无情（刘亦菲 饰）这对小情人，神侯府上下正其乐融融，空气却传来浓烈的血腥味道，三里之外的城郊老宅，杀人凶案正在发生！ 四大名捕前往现场，奋力追凶。 六扇门接获消息，捕神（成泰燊 饰）也带同姬摇花（江一燕 饰）等前来了解案情，双方合并追查，发现此案与六扇门早前追查的几宗灭门案有牵连。 悬案未决，六扇门却在碑林发现了捕神的尸体，而此前正是诸葛先生（黄秋生 饰）约捕神在碑林见面，一切线索都指向了诸葛先生。为探明真相，诸葛正我回到碑林查看，没想到却碰到了一位绝迹江湖多年的老朋友。双方对峙之时，四大名捕和六扇门也相继赶到，再生枝节。六扇门将诸葛先生和无情收押天牢。 四大名捕群龙无首，名存实亡。此时，王爷（李子雄 饰）忽访天牢，奉皇上旨意要即刻治无情死罪。铁血大牢之内，一场权力、仇恨、爱情、友情的角力就此展开……

北宋徽宗年间，镇远大将军凌落石与当朝奸相蔡京相互勾结，狼狈为奸，致使朝纲败坏，国势日衰。身兼武林大联盟副盟主的凌落石，更因觊觎武林盟主宝座，而趁盟主冷悔善过寿时，将其杀害，取而代之，冷悔善幼子冷血（蒋毅 饰）侥幸死里逃生，并为太傅诸葛神侯（岳跃利 饰）收养于狼窟中长大。诸葛神侯为对抗武功高强、阴险狠毒的凌落石，除个别传授冷血武功，亦同时培养另外三位极具资质潜力的血气青年追命（钟汉良 饰）、无情（朱磊 饰）、铁手（车仁表 饰）分别授与武功有成后，以分进合击方式，展开连串刺杀凌落石之艰巨任务。四人呗诸葛神封为“六扇门御前四方总捕” ——东方总捕铁手、南方总捕追命、北方总捕无情、西方总捕冷血，四人分别保卫着四方各地安宁。

金陵大牢被江湖神秘杀手闯入，死者竟只是一个矿工，六扇门受朝廷指令赶赴金陵大牢查探此案，本以为六扇门会派出一等一的捕快前去侦破，不料迎来的却是四位初出茅庐的女捕快，四人虽年纪轻轻，却个个身怀绝技。四人查到杀人案和金陵银矿有关，恐怕有人中饱私囊被发现才杀人，当查到最大帮派九龙也牵扯此事时，几人找到矿监陈增长，却不料和县令左衡之一样，惨遭毒手被人暗杀，带领四人的大师兄沐长风也在回京途中被人袭击身受重伤昏迷不醒，而此时，四人发现县令之子左靖的师父萧天南可能和陈增长勾结私吞银矿并杀人灭口，在失去大师兄的庇护之下，四个女孩利用自己的独门本事层层抽丝剥茧，最终摆脱险境将萧天南擒住，并帮助朝廷追回失踪的银矿。

城郊命案发生，四大名捕前往现场缉凶，不料引出十五年前杀害无情全家之惨案，名捕们顺藤摸瓜，牵出各种隐情，上演了一连串精彩冒险。个人恩怨与天下苍生之间，名捕们该如何抉择？又怎料血战之后，更大的风暴紧接而来。