迷你特工队研究所杰瑞米博士正在研究具有超强威力的能量“锕反应堆”，而另一方面蜥蜴军团队长宙斯企图用锕反应堆制造强大的武器威胁人类世界，并突袭迷你特工队研究所夺取锕反应堆。为夺回锕反应堆，本部计划组建精英团队，从各地召集了弗特、塞米、麦克斯、露西等队员。

与TV系列不同的全新剧情！ 追溯过去，迷你特工队诞生的故事。 迷你特工队研究所杰瑞米博士正在研究具有超强威力的能量“锕反应堆”，而另一方面蜥蜴军团队长宙斯企图用锕反应堆制造强大的武器威胁人类世界，并突袭迷你特工队研究所夺取锕反应堆。为夺回锕反应堆，本部计划组建精英团队，从各地召集了弗特、塞米、麦克斯、露西等队员。小松鼠弗特酷爱花生，具有电光石火的超能力，并且兼具着队长的使命带领着迷你特工队成功完成每一次的任务！赛米性格客观理性，外表冷酷的小猫头鹰！具有完美跳跃的超能力！麦克斯重情重义的胖乎乎的小海狸！具有超强绝对力量的超能力！露西美丽善良的沙漠小狐狸！拥有神奇魔法的超能力！他们并肩作战一起守护正义！